Ініціатива UJE зосереджує увагу на трьох засадничих взаємодоповняльних напрямках діяльності:
Науково-академічні й освітні ініціативи, зокрема вироблення «спільного історичного наративу», з метою створення правдивого й детального опису українсько-єврейських взаємин протягом сторіч із залученням провідних науковців й експертів з усього світу;
Створення на основі спільного історичного наративу низки інформаційних продуктів і проведення заходів для широкої аудиторії в Україні, Ізраїлі та діаспорі. Серед них онлайн-ресурси, книжки й інші публікації на відповідні теми, мультимедійні виставки, подкасти, навчально-освітні матеріали, документальні фільми, семінари, конференції, публічні зустрічі та події, а також спеціальні проекти;
Роз’яснювальна робота щодо історичних травм, як-от відновлення обізнаності з довоєнним життям євреїв на українських землях, визнання авторитетних наукових результатів стосовно історичного минулого України та захист і шанобливе ставлення до місць масових поховань.